植物线粒体基因组拼装新东西研制成功
来源：m6米乐娱乐 发布时间：2024-12-01 18:13:28
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近来，中国农业科学院深圳农业基因组研讨所绿色轻简超级稻遗传解析与分子育种立异团队开宣布一套新式植物线粒体基因组拼装东西GSAT。该东西能快速拼装图形化植物线粒体基因组，更好地评价其泛结构信息，为植物线粒体基因组的进化和功用研讨奠定了重要根底。相关研讨成果宣布在《生物信息学简报》
植物线粒体基因组分子结构各异，包含环状、线状、分枝状等，但是现有东西往往只能生成一个或多个环状方式的拼装成果，难以完好反映其本来结构信息。
为处理这一问题，研讨人员提出了图形化线粒体基因组的拼装方式，并开发了相应的拼装东西GSAT（下载地址：）。GSAT能使用二、三代高通量基因组测序数据，经过图形化比对战略快速拼装取得植物的图形化线粒体基因组。
凭借GSAT东西，研讨人员拼装得到水稻和拟南芥的线粒体基因组主图。基因组测序数据进一步支撑了线粒体基因组主图中的多种首要结构，展现了线粒体DNA分子的结构多样性。研讨依据成果得出，GSAT有望成为植物图形化线粒体基因组拼装的规范流程，为探明植物线粒体基因组的结构变异和功用进化规则供给有力东西。
该研讨得到了国家自然科学基金、深圳市科学技术立异委员会、中国农业科学院青年英才项目的支撑。
